Государственный историко-архитектурный и художественный музей-заповедник в Рыбинске — один из самых старых и больших музеев во всём регионе. В его фондах насчитывается более 120 тыс. экспонатов. История музея начинается с 1910 г., когда в Рыбинске открылась естественно-научная экспозиция. Официально художественно-исторический музей был открыт в 1919 г., и коллекция его состояла из национализированных шедевров старинных дворянских усадеб.
Сегодня в музее постоянно работают около 10 экспозиций. В их числе — выставки, посвящённые истории города и музея, а также природе края (в том числе с живыми зверями), археологическим находкам в области, энтомологии, а также декоративно-прикладному и изящному искусству.
Музей занимает видное историческое здание хлебной биржи, выстроенное в 1912 г. столичным архитектором А. Ивановым. Это здание на набережной, послужившее в 20 веке и военному госпиталю, и военному штабу, и городской лечебнице, было передано музею в 1992 г. Также к музею относится часть здания Мучного гостиного двора, возведённого в конце 18 века.
Музей может похвастать наиболее обширной коллекцией предметов западноевропейского искусства во всём регионе.
Богатейшее собрание музея состоит из ряда коллекций. В частности, музей может похвастать наиболее обширной коллекцией предметов западноевропейского искусства во всём регионе. Здесь можно увидеть работы итальянских, голландских, немецких, французских, английских мастеров 16—19 веков наряду со скульптурами 18—19 веков. Как минимум не менее интересна коллекция прикладного европейского искусства. В ней собраны средневековые итальянские майолики, фаянсовые изделия из Делфта и Веджвуда, изделия знаменитейших фарфоровых мануфактур Западной Европы 18—19 веков, китайский фарфор и керамика Дальнего и Ближнего Востока; предметы из декоративного стекла, изготовленные в Богемии и Силезии.
Музейные коллекции отечественных предметов искусства ничуть не менее богаты. Наиболее старинные экспонаты относятся к православной культуре: это печатные издания, иконы (самые древние датируются 16 веком), резные предметы из дерева, финифть и древние медные пластины 11 века. Художественное собрание включает шедевры таких мастеров, как Ф. Рокотов, И. Шишкин, В. Верещагин, И. Репин, А. Бенуа, Н. Рерих. Также в музее создана коллекция декоративно-прикладных изделий из стекла и фарфора отечественных заводов.
В 1967 г., когда С. Бондарчук снимал «Войну и мир», оригинальную мебель и аксессуары для съёмок предоставил музей-заповедник в Рыбинске.
В ходе осмотра исторических и археологических экспозиций можно познакомиться с домонгольской культурой населявших здешние края людей, увидеть предметы быта, старинные документы и фотоматериалы. Наиболее любопытные экспонаты коллекции, посвящённой флоре и фауне, — это части скелетов мамонтов, шерстистого носорога и доисторических бизонов.
Первый филиал музея был открыт в 1990 г. Им стал Мемориальный дом-музей А. Ухтомского, в котором учёный провёл детство и юность. Экспозиция, размещённая в небольшом деревянном здании, рассказывает о научной работе учёного, его взглядах на общественный строй и религию. Здесь можно увидеть воссозданный интерьер домашней гостиной и рабочего кабинета Ухтомского в Ленинграде.
Второй музейный филиал занимает часовню бывшего Афанасьевского монастыря. Сегодня в часовне находится Музей Мологского края. Он был открыт в 1995 г. и посвящён истории земель, которые оказались затопленными при создании Рыбинского водохранилища — в частности, города Молога, который ушёл под воду целиком вместе с семью сотнями старых поселений. В числе 300 предметов постоянной экспозиции музея — оригинальная мебель, бытовые и культовые предметы и археологические находки.