Никольская трапезная церковь, второй название которой Храм Николая Чудотворца, не в меньшей степени заслуживает вашего внимания. Это одна из древнейших церквей Богородице-Успенского Свияжского монастыря. Спустя некоторое время после основания церкви к ней была приставлена колокольня. Построенная из тёсанного известняка, который также называют белый камень, она также является самым высоким зданием города – высота составляет более 40 метров. Служители церкви полагают, что она в своё время стены церкви были покрыты фресками. Сейчас же сохранился лишь фрагмент фрески с изображением Николы Можайского на восточном фасаде. В Никольской трапезной церкви хранится также келья святителя Германа, представляющая особую ценность для всего монастыря. Туристы могут только смотреть на архитектуру храма снаружи, так как посещение церкви разрешено лишь монахам.
Церковь Николая Чудотворца, построенная в 1555-1556 гг., самое древнее каменное здание в Свияжске. Это одна из архитектурных жемчужин историко-культурного комплекса Свияжска. Представляет собой редкий тип церкви-колокольни с массивной башней на монолитном основании. Никольская церковь построена в монастыре почти одновременно со строительством Успенского собора, и, по-видимому, той же артелью псковских мастеров Ивана Ширяя. Рядом с церковью возведена трех-ярусная колокольня высотой 43 метра. Это самое высокое здание в Свияжске. На колокольне были установлены пять колоколов, наверху, еще во времена Ивана Грозного установлены башенные часы - государева данья. Из нижнего яруса колокольни к берегу Щучьего озера вел потайной подземный ход, предназначенный для снабжения водой - в случае осады Свияжской крепости. Позднее из кирпича надстроили еще два яруса колокольни. Внутри храма на восточном фасаде в нише сохранился фрагмент лика Николы Можайского. В церкви сохранилась древняя келья святителя Германа, в которой еще в начале 20 века находились его вещи. В 1990-е годы храм возвращен монастырю. В настоящее время продолжаются ремонтно-реставрационные работы.