История музея началась в 1862 году. В основу первой экспозиции легли экспонаты из аналогичного музея, функционировавшего в городе Жигулёвске. Коллекция была настолько мала, что помещалась в одном небольшом зале, сегодня же число экспонатов превышает 62 тысячи предметов. Всего в музее насчитывается 42 тематических коллекций.
Самая большая выставка носит название «Ставрополь провинциальный» и знакомит посетителей с историей города и всей области.
Главной гордостью музея являются коллекции предметов XVIII-XIX столетий, куда входят монеты, бытовые вещи и мебель.