Экспозиция состоит из семи отделов, посвященных истории, природе, культуре и другим сферам жизни. При музее работают выставки «Окно в Азию» и «Музейная студия». Так же гостям предлагается посетить библиотеку, научно-фондовый отдел, детский музейный центр. Музей действует с 1782 года. В 1879 году в Иркутске случился крупный пожар, в результате которого было уничтожено практически полгорода, в том числе, музей и библиотека. 4 года потребовалось, чтобы восстановить фонды и заново открыть выставку для посетителей. С того момента экспозиция функционирует постоянно.