Барнаульский Знаменский женский монастырь – одна из достопримечательностей Алтайского края. В июне 1754 г. в Барнауле состоялось освящение нововозведенной церкви в честь святых и праведных Захария и Елисаветы. Уже к 1772 г. церковное здание сильно обветшало. Тогда было принято решение построить новый храм. Новую деревянную церковь возвели в 1778 г. на средства, пожертвованные местными жителями. Автором данного проекта выступил ученик И. Ползунова И. Черницын.
В 1844 г. известный архитектор Турский разработал проект новой каменной трехпрестольной церкви, который представил на рассмотрение Томской губернской строительной комиссии. Однако этот проект не был воплощен в жизнь, и только в августе 1852 г. была получена грамота на сооружение нового каменного храма. Закладка храма произошла в 1853 г. Окончательный проект каменной церкви утвердили в 1856 г, а через два года на пожертвования верующих, на Сенной площади был возведен удивительный храм с трехъярусной колокольней и двенадцатью колоколами. В 1916 г. при Знаменской церкви возвели каменную часовню в честь 300-летия царствования дома Романовых.
После октября 1917 г. храм постигла такая же судьба, что и большинство других церквей на Руси – его закрыли. В октябре 1918 г. прихожане решили ежегодно вносить некоторую сумму денег для поддержания храма, однако новая власть не поддержала данную инициативу, и в 1922 г. под предлогом помощи голодающим Поволжья началась кампания по изъятию храмовых ценностей.
В апреле 1939 г. по решению Крайисполкома церковь окончательно закрыли. В том же году был снесен купол, разбита колокольня. Немного позже у здания надстроили второй этаж и сделали другие пристройки. Церковь утратила исторический облик.
В конце 1992 г. ее возвратили Православной Церкви. От красивого храма остались лишь стены, исковерканные пристройками. Вскоре начались работы по восстановлению разрушенного храма. В 1994 г. при Знаменской церкви был основан женский монастырь. На сегодняшний день в монастыре 20 насельниц.